Jaakko Mäntyjärvi jest jako muzyk pół-profesjonalistą. Był członkiem wielu fińskich chórów, w tym Savonlinna Opera Festival Choir, zawodowego zespołu Sibelius Academy Vocal Ensemble oraz The Tapiola Chamber Choir. W latach 1988-1993 dyrygował chórem studenckim Savolaisen Osakunnan Laulajat, a w latach 1998-2004 był zastępcą dyrektora Tapiola Chamber Choir. W roku 2001 skomponował utwór Cornish Lullaby dla helsińskiego męskiego chóru akademickiego KYL (Kauppakorkeakoulun Ylioppilaskunnan Laulajat). Utwór ten uzyskał jedną z nagród na V Międzynarodowym Festiwalu Chórów Męskich w Kornwalii.

W roku 2012 otrzymał zamówienie zespołu Exultate Singers z Bristolu na napisanie kompozycji do tekstu Iste Mundus. Utwór miał premierę w kościele św. Jerzego w Bristolu 23 lutego 2013 roku. Wśród jego pozostałych kompozycji chóralnych są m.in. Four Shakespeare Songs (1984), Dagen svalnar... (1991/93), Ave Maria (1991), Pseudo-Yoik (1994), El Hambo (1997), More Shakespeare Songs (1997); jego utwór Canticum Calamitatis Maritimae otrzymał w 1997 roku trzecią nagrodę w europejskim konkursie chórów katedralnych. Otrzymuje wiele zamówień na utwory na chór mieszany. Skomponował m.in. utwory dla Seminarium Muzyki Współczesnej przy Cork International Choral Festival (1999), zespołu Chanticleer (2001) oraz The King’s Singers (2002). Inna jego kompozycja chóralna zabrzmiała na uroczystości 700. rocznicy poświęcenia katedry w Turku (2000). W latach 2000-2005 był kompozytorem rezydentem Tapiola Chamber Choir. W roku 2006 otrzymał zamówienie festiwalu w Tallinie na 40-częściowy utwór chóralny Tentatio.

Jaakko Mäntyjärvi określa siebie jako eklektycznego tradycjonalistę. Eklektycznego dlatego, że wykorzystuje elementy różnych stylów muzycznych, łącząc je w swój własny styl; tradycjonalistę – gdyż jego język muzyczny przystosowany jest do realizowania tradycyjnych celów i jedynie oszczędnie korzysta z nowatorskich środków muzyki XX wieku. Ponieważ sam jest wykonawcą, jego muzyka jest zorientowana praktycznie.